Según la información de un individuo el carácter correspondiente adquiere un aspecto determinado, por ejemplo, el carácter "color de ojos" puede tener dos formas, el color claro y el color oscuro, o el carácter "forma del pelo" puede tener también dos formas, pelo liso o pelo rizado, etc.; cada carácter suele presentar dos o más formas diferentes. A cada uno de los aspectos o manifestaciones concretas de un carácter se le denomina FENOTIPO, que viene a ser, más o menos, aquello que podemos ver o detectar con nuestros sentidos en un individuo determinado.

De la misma manera que un carácter presenta varias manifestaciones, un gen puede tener también varias formas, ya que cada fenotipo se tiene que corresponder con una forma distinta del gen; cada forma diferente que puede tener un gen se denomina ALELO. En las especies diploides cada cadena de ADN está dos veces, una viene del padre y otra de la madre (CADENAS O CROMOSOMAS HOMÓLOGOS), y cada gen está también dos veces, uno en cada cadena, por lo que realmente cada carácter está determinado por la acción de dos alelos, que pueden ser iguales o diferentes, por ejemplo el caso del color de ojos, el fenotipo "color claro" se debe a la acción de un alelo, y el fenotipo "color oscuro" se debe a la acción de otro alelo diferente; un individuo determinado puede tener los dos alelos iguales o diferentes en el mismo par. Cuando los dos alelos de un par son iguales al individuo se le denomina HOMOCIGOTO o raza pura, en terminología mendeliana; si los dos alelos del par son diferentes hablamos de individuos HETEROZIGOTOS o híbridos.

Los cromosomas homólogos, por tanto, son aquellos que tienen los mismos genes, pero pueden tener diferentes alelos.

El conjunto de alelos de un individuo para uno o varios caracteres determinados se denomina GENOTIPO. El genotipo es algo más amplio que el fenotipo, ya que no se manifiestan todos los alelos que poseemos, muchos quedan ocultos, escondidos y así se puede dar el caso de fenotipos que presentan nuestros abuelos, nuestros padres no los tienen y luego nosotros volvemos a manifestarlos, ésto representaría la existencia de unos alelos que han quedado ocultos en nuestros padres.

- HERENCIA DOMINANTE: es aquella en la que uno de los alelos tiene más fuerza para manifestarse que el otro; al más fuerte se le denomina ALELO DOMINANTE y al más débil, ALELO RECESIVO, de manera que cuando están juntos el dominante y el recesivo, el dominante se manifiesta mientras que el recesivo queda oculto; en el ejemplo del color de ojos el alelo para ojos oscuros domina sobre el alelo para ojos claros, por lo que en cuanto aparece el alelo de ojos oscuros, se manifiesta y se da el fenotipo de ojos oscuros y para que se de ojos claros el individuo debe ser homocigoto para el alelo recesivo. Para representar este tipo de alelos se nombran con letras de manera que al alelo dominante se le nombra con una letra mayúscula y al recesivo se le nombra con la misma letra, pero minúscula:

CARÁCTER: Color de ojos
FENOTIPOS: Color claro (recesivo) y color oscuro (dominante)
ALELOS: A = color oscuro a = color claro
GENOTIPOS: AA = ojos oscuros (homocigoto dominante)
Aa = ojos oscuros (heterozigoto)
aa = ojos claros (homocigoto recesivo)

- HERENCIA INTERMEDIA: es aquella en que los alelos de un gen tienen la misma fuerza para manifestarse por lo que ninguno domina sobre el otro, denominándoseles entonces ALELOS CODOMINANTES; en este caso aparece un nuevo fenotipo que es intermedio entre los otros, como sucede por ejemplo con una planta llamada "dondiego", que puede tener flores blancas y rojas que al cruzarse dan lugar a plantas de flores rosas (intermedio); en este caso los alelos se nombran con letras mayúsculas:

CARÁCTER: Color de la flor
FENOTIPOS: Color blanco, rojo y rosa
ALELOS: B = color blanco R = color rojo
RB = color rosa
GENOTIPOS: BB = color blanco (homocigoto)
RR = color rojo (homocigoto)
BR = color rosa (heterozigoto)